2018年1月22日，在国家知识产权局公布的《备案在册的产业知识产权联盟名单(国知联备2018001)》中，广州医药产业知识产权联盟获得国家知识产权局备案。
近年来，广州市委市政府高度重视科技进步和创新发展，尤其是创新发明专利知识产权工作。在《中共广州市委贯彻落实<中共中央关于全面深化改革若干重大问题的决定>的意见》等文件中，都把知识产权创新、运用和保护放在重要位置。知识产权作为产业核心竞争力的体现，近年来越来越被企业所重视，也逐步成为医药行业的重要工作内容。广州市各医药企业在知识产权方面成果斐然，全市专利、商标、版权的注册数量节节攀升，质量也不断提高。在这样的背景下，单一企业在知识产权运用和保护工作中遇到越来越多的问题，很多时候需要跨多家企业合作协调解决。同时，随着广州医药产业知识产权工作的深入开展，企业间在市场竞争和产品知识产权运用和保护中时有联合。为共同搭建一个更大的平台，保护会员单位知识产权免受仿冒伤害，促进产业自律抱团合作参与国内外知识产权竞争，已成为会员单位的共同心声。
2015年开始，广州市知识产权局领导及相关处室领导多次与广州医药行业协会联系组建医药产业知识产权联盟事宜，有关领导还亲临行业协会指导开展具体筹建工作，使联盟筹建工作得以顺利进行。
2017年6月9日，广州医药行业协会的努力下，联合广州三环专利代理有限公司、广州医药集团有限公司等30家单位共同发起成立了广州医药产业知识产权联盟。联盟的成立，标志着广州市医药产业知识产权工作进入新的阶段，并走在全国前列。
联盟成立后，同年9月5日向国家知识产权局申请备案，经广州市知识产权局和广东省知识产权局审核同意推荐，并由广东省知识产权局报送国家知识产权局申请备案，于2018年1月22日获得国家知识产权局批准备案。
广州医药产业知识产权联盟是广州市首家获得国家知识产权局批准备案的医药产业知识产权联盟，也是广州市首家获得国家知识产权局批准备案的产业知识产权联盟。